La esterilización por calor seco se utiliza generalmente para materiales que toleran altas temperaturas, generalmente de metal o vidrio. Es el método de elección siempre que sea posible, pues la superficie del material de vidrio, al ser la que está en mayor contacto con el producto, puede ser origen de contaminación pirogénica, siendo el calor seco un buen agente de destrucción de pirógenos.

Además tiene la ventaja de que, al finalizar el ciclo, el material sale seco.